Also bei mir ist das Jogwheel nach dem Start voreingestellt 
Es stimmt zwar, dass die CC121-Fensterposition nicht im Cubase-Projekt mit gespeichert wird.
Warum auch?
Wenn Du den CC vor Dir hast, wovon ich mal ausgehe - ein längerer Knopfdruck auf den JOG-Taster, und das Menü erscheint in Cubase. Mit dem selben Knopf kannst Du dann zwischen den 3 Modi (Jog / Shuttle / Scrub) hin- und herschalten.
Gruß
Pat