Ich hatte nach einiger Verzögerung dann doch Antwort vom Support und es hat nicht mit dem Lib Manager zu tun.
Ich habe es gelöst bekommen, in dem ich das letzte Update geladen habe, das PlugIn neu gescannt habe und die aktuelle eLicencer Software geladen habe. Danach hat Logic die Samples von Padshop erkannt und geladen.