Hast Du die Einstellungen mal exportiert? Ich glaube das liegt daran. Einstellungen machen, exportieren, Cubase schließen und wieder öffnen. Alle Einstellungen sollten da sein. Ich hab es nicht getestet aber seit dem ich das so gemacht habe geht es bei mir und jedes mal wenn ich die Einstellungen verändere exportiere ich. Das klappt.