Audio-Problem: aus avi extrahierter Ton kürzer als Video

11 Stunden??? Krass!
Ich würde mal tippen, dass die Samplerate von der AVI-Datei und die des Projektes nicht übereinstimmen.
Könnte in eurem Fall sein, dass die AVI eine Samplerate von 44,1 kHz und das Projekt eine von 48 hat.
In dem Fall entweder beim Extrahieren die Konvertierungsoption aktivieren oder die Samplerate des Projektes an das der AVI-Datei anpassen.
Was für eine Samplerate die AVI hat, müsstest Du im Pool sehen, oder wenn Du im Windows/Mac-OS dir die Eigenschaften der Datei anzeigen lässt.