Habe ein Lösung vom Support bekommen. Man muss die Einstellungen zurücksetzen - dann sind die Presets wieder da. Die alten selbst gesüeicherten Einstellung gehen dabei zunächst verloren. Aber man kann sie vom umbenannten Ordner dann zurückopieren, soweit man sie braucht (und die richtigen xml-Dateien findet…).
Hier ist das in der KNOWLEDGE BASE beschrieben:
https://www.steinberg.net/nc/de/support/knowledgebase_new/show_details/kb_show/troubleshooting-instructions-for-cubase-nuendo-and-sequel-on-windows#preferences